夏休みのある日。のび太は「地球には、まだ隠された秘境があるはずだ!」と大冒険できる場所を探しはじめる。そんな時、空き地で出会った子犬・ペコが、山積みの衛星写真から、ジャングルの奥地に立つ謎の巨神像を見つけ出した。のび太たち5人とペコは、巨神像の謎を解き明かすため、ジャングルに向かう。数々のピンチを乗り越えて辿り着いた先は、人間とは別に独自の進化を遂げた犬の国“バウワンコ王国”。しかし王国は、世界征服を企む大臣に支配されていた!
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